şizoafektif bozukluk tanısı için, psikotik belirtilerin mutlaka bir duygudurum dönemi sırasında ortaya çıkmış olmasını gerekli görür; yani bir duygu durum dönemi olmaksızın kendi başına ortaya çıkan psikotik belirtilerin varlığı, tanıyı şizoaffektif bozukluğun da ötesine şizofreniye doğru götürecektir. şizoafektif ve şizofrenik bozuklukları ayırmak için ise, uzunlamasına gidişe bakmak önerilir. Eğer hastanın geçirdiği duygudurum dönemlerinin süresi,toplam hastalık süresi içinde önemli bir yer tutuyorsa, tanı şizoaffektif bozukluk; tersi durumda ise şizofreni olacaktır. Ancak, buradaki önemli süre kavramının bulanık ve öznel olduğu açıktır. Yani, şizoafektif bozukluk ölçütleri henüz belirsiz görünmektedir.bu nedenle birçok klinisyen, duygudurum bozukluğu ile şizofreni arasında ayırıca tanı yapamadıkları ve duygudurum bozukluğu dönemleri ile psikotik dönemleri çeşitli oranlarda karışık şekilde yaşayan; ancak, işlevsellik düzeyi tam ya da oldukça iyi kalmış olguları, şizoafektif bozukluk olarak görme eğilimindedirler.
Bipolar depresyona da psikoz eşlik edebilir.